لقد ألف سماحته عشرات الكتب في شتى الحقول الدينية المختلفة ومنها ما طبع في حياته ومنها ما هو قيد التحقيق ومنها ما طبع بعد وفاته رضوان الله عليه، وهذا النموذج من الكتب التي ألفها سماحة الإمام قدس سره وتشمل باقة غنية من أهم المصنفات التي يعتمد عليها المئات بل الآلاف من طلبة العلوم الدينية في كافة أرجاء المعمورة:
١ ـ أجود التقريرات، في أصول الفقه.
٢ ـ البيان، في علم التفسير.
٣ ـ نفحات الاعجاز، في علوم القرآن.
٤ ـ معجم رجال الحديث وتفصيل طبقات الرواة، في علم الرجال، في ٢٤ مجلداً.
٥ ـ منهاج الصالحين، في بيان أحكام الفقه، في مجلدين وقد طبع ٢٨ مرة.
٦ ـ رسالة في اللباس المشكوك، في الفقه.
٧ ـ توضيح المسائل، في بيان أحكام الفقه، الرسالة العملية لمقلديه، طبع أكثر من ثلاثين مرة وبعدة لغات.
٨ ـ المسائل المنتخبة، في بيان أحكام الفقه، الرسالة العملية لمقلديه باللغة العربية، طبع أكثر من عشرين مرة.
٩ ـ تكملة منهاج الصالحين، في بيان أحكام الفقه، في القضاء والشهادات والحدود والديات والقصاص.
١٠ ـ مباني تكملة المنهاج، في أسانيد الأحكام الفقهية، في القضاء والشهادات والحدود والديات والقصاص.
١١ ـ تعليقة العروة الوثقى، لبيان آرائه الفقهية على كتاب "العروة الوثقى" لفقيه الطائفة المغفور له آية الله العظمي السيد محمد كاظم اليزدي قدس سره.
كما و لا يزال البعض الآخر من مؤلفاته مخطوطا.